Максималните нива на микотоксини и други замърсители в храните, изброени по-долу , са определени в Регламент (ЕО) 1881/2006 и последващите изменения.

Следните замърсителите попадат в обхвата:

• микотоксини (афлатоксини, охратоксин А, фузариум токсини, патулин и цитринин ...),
• метали (олово, кадмий, живак, неорганичен калай),
• 3-монохлорпропан-1,2-диол (3-MCPD),
• полициклични ароматни въглеводороди (ПАВ),
• меламин,
• ерукова киселина,
• нитрати.

Други свързани директиви и регламенти на ЕС: 

• Директива 2003/74/ЕО: Хормони
• EО 2073/2005: Микробиология
• Директива 1999/2/ЕО и 1999/3/ЕО: Облъчване
• Директива 96/23: Ветеринарна медицина
• Регламент EC1829/2003: ГМ храни и фуражи
• Директива 2002/32/ЕО на Съвета относно нежеланите вещества в храните за животни

Директива 2002/32/ЕО установява максималните нива на замърсители, включително микотоксини, които са разрешени във фуражите. Поради голямото изменение всяка година и ограничено пренасяне от храната  към фуража на фузариум токсини и охратоксин А, е приет двуетапен подход за тези микотоксини в Препоръка 2006/576/ЕО.

Разпоредбите за методите за вземане на проби и анализ за целите на официалния контрол на микотоксини са въведени в Регламент (ЕО) № 401/2006.